أنشئت جامعة حضرموت بالقرار الجمهوري رقم (45) لسنة 1993م، ويقع المركز الرئيسي للجامعة في مدينة المكلا عاصمة محافظة حضرموت ، ولها حاليًا عدد من الكليات في كل من المكلا ومدينة الغيضة بمحافظة المهرة ، وجزيرة  سقطرى .

وقد بدأت الدراسة في مساق البكالوريوس فيها في العام الجامعي 1995-1996م بافتتاح 3 كليات هي : الهندسة والبترول ،كلية البنات و كلية التربية – سيئون ، وبلغ عدد الكليات في العام الجامعي 2019-2020 خمس عشر كلية، إضافة الى خمسة مراكز بحثية ومركز استشاري وعدد من المراكز الخدمية . ويتبع الجامعة مراكز تدريبية هي :  مستشفى جامعي ومركز صحي وروضة للأطفال .

     بلغ اجمالي الطلاب المقيدين في العام الجامعي 2017- 2018 م ( 14387 ) طالب وطالبة وبلغ اجمالي عدد الخريجين حتى العام الجامعي 2016-2017 م( 27068) طالب وطالبة .

ويبلغ عدد اجمالي عدد اعضاء الهيئة التدريس ومساعديهم   في العام الجامعي  2017-2018م ثمانمائة وتسعة ( 809) ، وتعمل الجامعة على ابتعاث الهيئة التدريسية المساعدة  الى مختلف الجامعات حيث يبلغ عدد المبعوثين في الخارج مئتان وثمانية وعشرين  ( 228)  لنيل الماجستير والدكتوراه .

بدأت الدراسة في مساق الماجستير من العام الجامعي 2001-2002 م، إذ يبلغ عدد برامج الماجستير 44 برنامجا حالياً، وبلغ عدد المقيدين في العام الجامعي 2017-2018 م ( 786 ) طالب وتخرج منها حتى العام الجامعي 2016- 2017 م (362 ) خريج . ولبرنامج الدكتوراه  بدأت الدراسة فيه في العام الجامعي 2014-2015 م .

والجامعة عضو عامل في اتحاد الجامعات العربية واتحاد جامعات العالم الإسلامي واختير رئيس الجامعة في الدورة الخمسين لمؤتمر الاتحاد عضوا في المكتب التنفيذي للاتحاد.